Flore et faune mondiales

Les termes flore et faune trouvent leur origine dans les personnifications classiques des plantes et des animaux, Flora étant la déesse romaine des fleurs et Fauna une divinité champêtre associée aux champs et aux forêts. En biologie moderne, la flore désigne toutes les espèces végétales d'une région ou d'une période donnée, et la faune désigne toutes les espèces animales. Prises ensemble, la flore et la faune mondiales décrivent la couche vivante de la planète, sa biosphère, des calottes glaciaires polaires aux forêts tempérées et prairies jusqu'aux récifs coralliens et à l'océan ouvert. Les champignons, un règne biologique distinct, sont souvent culturellement traités aux côtés de la flore en raison de leur regroupement traditionnel avec les plantes dans les anciens manuels, bien que génétiquement ils soient plus proches des animaux que des plantes.

La vie sur Terre est classée selon une hiérarchie de rangs taxonomiques descendant des domaines et règnes jusqu'aux embranchements, classes, ordres, familles, genres et espèces. Les trois domaines reconnus dans la systématique moderne sont les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes. Au sein des Eucaryotes se trouvent les règnes familiers Plantae, Animalia, Fungi et plusieurs règnes de protistes qui incluent les algues, les amibes et d'autres organismes unicellulaires. Parmi ceux-ci, les plantes et les animaux forment ensemble les composantes les plus visibles des écosystèmes terrestres et aquatiques, et ils dominent l'imaginaire public de la biodiversité, mais les micro-organismes représentent la plus grande part de la diversité génétique décrite et non décrite.

La biodiversité mondiale n'est pas répartie uniformément. Les latitudes tropicales abritent un nombre disproportionné d'espèces, un schéma connu sous le nom de gradient de diversité latitudinal. Les tropiques humides du bassin amazonien, du bassin du Congo, de Bornéo, de Nouvelle-Guinée et de Madagascar accueillent les communautés terrestres les plus riches, tandis que les récifs coralliens du triangle indo-pacifique délimité par les Philippines, l'Indonésie et la Papouasie-Nouvelle-Guinée supportent les plus grands nombres d'espèces marines. Les îles, qui font souvent évoluer des espèces que l'on ne trouve nulle part ailleurs, et les chaînes de montagnes isolées contribuent toutes deux à des concentrations d'espèces endémiques qui élèvent leur importance pour la conservation bien au-delà de leur part de la surface terrestre.

L'activité humaine a accéléré le rythme du changement biologique si brutalement que de nombreux scientifiques décrivent la période actuelle comme un épisode d'extinction de masse provoqué par l'homme. La Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques a signalé en 2019 qu'environ un million d'espèces végétales et animales sont menacées d'extinction, beaucoup dans les décennies à venir. Cet article examine les principaux groupes de plantes et d'animaux, le cadre biogéographique selon lequel ils sont organisés, les points chauds et les pays mégadivers qui portent la plus grande part de la richesse biologique, ainsi que les outils institutionnels utilisés pour les décrire, les surveiller et les conserver.

La classification biologique des organismes vivants est née avec le naturaliste suédois Carl von Linné, dont le Systema Naturae, publié progressivement à partir de 1735, a établi la convention de dénomination binomiale et la hiérarchie imbriquée de règnes, classes, ordres, genres et espèces encore utilisée aujourd'hui. Linné reconnaissait deux règnes de vie macroscopique, Plantae et Animalia. Au cours du vingtième siècle, l'expansion de la microscopie et des outils moléculaires a forcé une réorganisation de la vie en règnes supplémentaires, notamment Fungi en tant que groupe indépendant en 1969 dans le système à cinq règnes de Robert Whittaker, puis un système à trois domaines proposé par Carl Woese en 1990 basé sur les séquences d'ARN ribosomique.

La phylogénétique moderne distingue trois domaines. Les Bactéries et les Archées sont des procaryotes, organismes unicellulaires sans noyau. Les Archées, découvertes dans des environnements extrêmes mais ultérieurement trouvées abondantes dans les sols et les océans, forment une lignée évolutive distincte des Bactéries malgré des similitudes superficielles. Le troisième domaine, les Eucaryotes, englobe toute vie cellulaire dotée d'un noyau lié à une membrane, y compris Plantae, Animalia, Fungi et une collection diverse de protistes incluant les algues vertes, les algues brunes, les diatomées, les ciliés et les myxomycètes. Les chloroplastes et les mitochondries à l'intérieur des cellules eucaryotes sont compris comme étant les descendants évolutifs d'anciens endosymbiontes bactériens, comme l'a proposé Lynn Margulis.

Au sein des Eucaryotes, le règne Plantae inclut les plantes terrestres et, selon la classification, plusieurs lignées d'algues. Animalia comprend les hétérotrophes multicellulaires qui ingèrent de la nourriture, et Fungi sont des hétérotrophes multicellulaires ou unicellulaires qui absorbent les nutriments extérieurement. Les projets d'arbre de la vie à grande échelle, notamment le programme Darwin Tree of Life dirigé par le Wellcome Sanger Institute, visent à séquencer le génome de chaque espèce eucaryote en Grande-Bretagne et en Irlande comme modèle pour un effort mondial. Des initiatives parallèles comme le Earth BioGenome Project ciblent le séquençage de toutes les 1,8 million d'espèces eucaryotes connues en une décennie. Ces ressources génomiques remodèlent l'arbre de la vie en temps réel, réordonnant occasionnellement des groupes dont les relations n'avaient été comprises qu'à partir de la morphologie.

Les champignons sont un règne distinct d'organismes eucaryotes qui, bien que souvent regroupés dans le langage courant avec les plantes, sont évolutivement plus proches des animaux. Ils incluent les champignons familiers, les moisissures, les levures, les lichens et une vaste majorité microbienne. Le State of the World's Fungi de Kew rapporte environ 155 000 espèces décrites, tandis que les estimations statistiques situent le total réel entre 2,2 et 3,8 millions, ce qui signifie que seulement environ cinq pour cent de la diversité fongique a été formellement nommée. Le Système mondial d'information sur la biodiversité et le Catalogue of Life suivent les enregistrements d'occurrence fongique, et MycoBank, basé au Royaume-Uni, sert de registre nomenclatural international pour les nouveaux taxons fongiques.

Les champignons jouent trois rôles écologiques principaux. En tant que décomposeurs, ils recyclent le matériel végétal mort et retournent les nutriments au sol, une fonction sans laquelle le carbone s'accumulerait et les écosystèmes terrestres s'effondreraient. En tant que mutualistes, ils forment des associations mycorhiziennes avec plus de 90 pour cent des plantes terrestres, échangeant des nutriments du sol contre des sucres fabriqués par les plantes, et ils s'associent avec des algues photosynthétiques ou des cyanobactéries pour former des lichens. En tant que parasites, ils causent de nombreuses maladies végétales, notamment la rouille du blé, la brûlure du châtaignier et la chytridiomycose amphibienne qui a provoqué des déclins mondiaux spectaculaires chez les grenouilles et les salamandres.

Les champignons sont importants pour les économies humaines. Les levures fermentent le pain, la bière, le vin et les biocarburants. L'antibiotique pénicilline dérivé de Penicillium a révolutionné la médecine, et les médicaments ultérieurs dérivés de champignons incluent la cyclosporine et les statines hypocholestérolémiantes. Les champignons comestibles tels que le champignon de Paris, le shiitake et le pleurote sont cultivés commercialement, tandis que les truffes restent parmi les produits agricoles les plus chers au monde. Les mycologues en pathologie végétale suivent les maladies fongiques émergentes qui menacent les bananes, le café et les céréales de base, une tâche d'importance croissante à mesure que le changement climatique modifie les distributions.

La biodiversité est mesurée et suivie par un réseau interdépendant d'institutions scientifiques et d'infrastructures de données numériques. L'Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) maintient la Liste rouge des espèces menacées, la norme mondiale pour l'évaluation du risque d'extinction. Chaque espèce est évaluée selon des critères quantitatifs de taille de population, de déclin et de répartition géographique et placée dans des catégories allant de Préoccupation mineure à Quasi menacée, Vulnérable, En danger, En danger critique et Éteinte. Lors de la mise à jour 2024, la Liste rouge avait évalué plus de 166 000 espèces, dont plus de 47 000 sont menacées d'extinction, notamment environ 41 pour cent des amphibiens, 37 pour cent des requins et raies et 26 pour cent des mammifères.

Le Système mondial d'information sur la biodiversité (GBIF), dont le siège est à Copenhague, agrège les enregistrements d'occurrence des musées d'histoire naturelle, des plateformes de science citoyenne et des enquêtes de recherche. Son ensemble de données dépasse 2,5 milliards d'enregistrements et est librement accessible à tous. Le Catalogue of Life, géré conjointement par Species 2000 et le Système d'information taxonomique intégré, fournit une liste de contrôle mondiale unifiée des noms d'espèces actuellement acceptés. iNaturalist, géré par l'Académie des sciences de Californie et la National Geographic Society, est devenu la plus grande plateforme de science citoyenne pour la biodiversité, avec plus de 200 millions d'observations de qualité recherche contribuées par des millions d'utilisateurs. Les plateformes spécifiques à des projets incluent eBird (Cornell Lab of Ornithology) pour les oiseaux et AmphibiaWeb (UC Berkeley) pour les amphibiens.

Au niveau institutionnel, le Musée national d'histoire naturelle du Smithsonian, le Muséum d'histoire naturelle de Londres et les Jardins botaniques royaux de Kew préservent des spécimens de référence qui ancrent les descriptions d'espèces, et Plants of the World Online de Kew est la liste de contrôle végétale faisant autorité. Les méthodes modernes incluent le code-barres ADN, centralisé dans le Barcode of Life Data System (BOLD) à l'Université de Guelph, et l'échantillonnage d'ADN environnemental (ADNe), qui détecte les espèces à partir de matériel génétique trace dans l'eau ou le sol. Ensemble, ces outils accélèrent considérablement le rythme de découverte des espèces et de surveillance du déclin des espèces, complétant des siècles d'histoire naturelle descriptive.

Les espèces non indigènes qui établissent des populations auto-suffisantes et nuisent aux écosystèmes indigènes, aux économies ou à la santé publique sont connues sous le nom d'espèces invasives. Elles figurent parmi les principaux facteurs directs de perte de biodiversité mondiale aux côtés de la perte d'habitat, de la surexploitation et du changement climatique. Le Groupe de spécialistes des espèces invasives de l'UICN maintient la Base de données mondiale sur les espèces invasives, qui suit des milliers d'espèces invasives établies dans le monde. Les écosystèmes insulaires, où les espèces endémiques ont évolué sans prédateurs ou compétiteurs mammifères, sont particulièrement vulnérables, et les programmes de restauration insulaire qui éradiquent les rongeurs et chats invasifs ont permis de rétablir de nombreux oiseaux marins, reptiles et plantes en danger.

Des exemples bien documentés incluent la moule zébrée (Dreissena polymorpha), qui s'est propagée du bassin caspien à travers les Grands Lacs et l'Europe, obstruant les infrastructures et déplaçant les mollusques d'eau douce indigènes. Le crapaud buffle (Rhinella marina), introduit en Australie en 1935 pour contrôler les ravageurs de la canne à sucre, s'est étendu à travers le nord de l'Australie et empoisonne les prédateurs qui tentent de le manger. La jacinthe d'eau (Pontederia crassipes), originaire de l'Amazone mais introduite mondialement comme ornementale, étouffe les lacs et rivières tropicaux du lac Victoria au lac Taihu. Le serpent arboricole brun (Boiga irregularis) est arrivé à Guam dans des cargaisons après la Seconde Guerre mondiale et a exterminé la plupart des oiseaux forestiers indigènes dans les années 1980.

D'autres espèces invasives à fort impact incluent la rascasse volante indo-pacifique (Pterois volitans et P. miles) désormais dominante dans l'Atlantique occidental et les Caraïbes, l'escargot géant africain (Lissachatina fulica), l'herbe à cogon (Imperata cylindrica) et l'étourneau sansonnet (Sturnus vulgaris), introduit en Amérique du Nord dans les années 1890 et comptant désormais des centaines de millions d'individus. La gestion combine des inspections de biosécurité aux points d'entrée, la détection précoce et la réponse rapide, le contrôle physique et chimique, et des agents de lutte biologique ciblés. La Convention internationale pour la protection des végétaux (CIPV) et l'Organisation mondiale de la santé animale coordonnent les efforts internationaux.

Les citations détaillées, les références de données et les sources institutionnelles pour l'ensemble du contenu de CountryReports sont répertoriées sur la page Sources. Les organisations internationales, institutions scientifiques, musées et revues à comité de lecture suivants sont les principales autorités sur lesquelles nous nous appuyons pour le contenu relatif à la flore et à la faune mondiales. Chaque lien pointe vers la page d'accueil de l'institution ou le sous-site pertinent.

Bases de données mondiales sur la biodiversité

• Liste rouge des espèces menacées de l'UICN — L'inventaire mondial faisant autorité du statut de conservation des espèces, maintenu par l'Union internationale pour la conservation de la nature.
• Système mondial d'information sur la biodiversité (GBIF) — Une infrastructure internationale en libre accès agrégeant plus de 2,5 milliards d'enregistrements d'occurrence d'espèces dans le monde.
• Catalogue of Life — Une liste de contrôle mondiale unifiée de plus de 2,1 millions de noms d'espèces, régie par Species 2000 et le Système d'information taxonomique intégré.
• iNaturalist — La plateforme phare de science citoyenne pour la biodiversité, initiative conjointe de l'Académie des sciences de Californie et de la National Geographic Society.
• Plants of the World Online (Kew) — La liste de contrôle en ligne faisant autorité des plantes vasculaires du monde des Royal Botanic Gardens de Kew.
• Barcode of Life Data System (BOLD) — La bibliothèque de référence internationale de codes-barres ADN à l'Université de Guelph, Canada.

Organismes internationaux de conservation

• Conservation International — Maintient le cadre des 36 points chauds de biodiversité et la désignation des 17 pays mégadivers.
• Convention sur la diversité biologique (CDB) — Le traité international adopté au Sommet de la Terre de Rio en 1992 et ses cadres successeurs, y compris le Cadre mondial de la biodiversité de Kunming-Montréal.
• Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) — L'organisme scientifique des Nations Unies produisant des évaluations mondiales de la biodiversité et des services écosystémiques.
• Centre de surveillance de la conservation de la nature du Programme des Nations Unies pour l'environnement (WCMC) — Bras analytique du PNUE sur la politique de biodiversité, les aires protégées et les données sur les espèces.
• CITES — La Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d'extinction, adoptée en 1973.

Musées d'histoire naturelle et institutions de recherche

• Musée national d'histoire naturelle du Smithsonian — Abrite plus de 146 millions de spécimens et sert d'institution de référence pour la taxonomie nord-américaine et mondiale.
• Royal Botanic Gardens, Kew — L'institution principale du Royaume-Uni pour la science des plantes et des champignons, abritant la Millennium Seed Bank à Wakehurst.
• Darwin Tree of Life — Un programme dirigé par le Wellcome Sanger Institute pour séquencer les génomes de toutes les espèces eucaryotes en Grande-Bretagne et en Irlande comme contribution au Earth BioGenome Project.
• Encyclopedia of Life — Un agrégateur mondial en libre accès de pages d'espèces, maintenu avec des contributions des musées d'histoire naturelle et des institutions de recherche.
• Science — Revue à comité de lecture de l'American Association for the Advancement of Science, éditeur de nombreux articles fondamentaux sur la biodiversité.
• Mora et al., 2011 (PLOS Biology) — « Combien d'espèces y a-t-il sur Terre et dans l'océan ? » — l'estimation statistique d'environ 8,7 millions d'espèces eucaryotes.

Si vous remarquez une erreur ou souhaitez suggérer une correction, veuillez utiliser notre page de contact pour nous joindre.